Cũng như nhiều cột mốc được đánh dấu trên những miền đất đặc biệt của Tổ quốc, công trình cột cờ ở núi Thới Lới có dạng kiến trúc gồm đài cột, thân cột cờ, bậc thềm và khuôn viên xung quanh có 4 bức điêu khắc hình ngọn lửa dựa trên biểu trưng của Hội Sinh viên Việt Nam. Phần móng được vùi sâu dưới lớp đá với kỹ thuật kết cấu móng thường sử dụng cho những ngọn hải đăng kiên cố. Đài cột cờ có chiều cao 5m, có thân màu trắng bao quanh bởi khối màu đỏ mang sắc màu của lá quốc kỳ thiêng liêng.
 
Công trình này có sự đầu tư lên đến 850 triệu đồng, bao gồm sinh viên cả nước đóng góp 150 triệu đồng, Ngân hàng Đầu tư và phát triển VN hỗ trợ 700 triệu đồng. Đây là công trình thuộc khuôn khổ chuỗi hoạt động “Sinh viên với biển đảo Tổ quốc” năm 2013, với mục đích lập thành tích chào mừng Đại hội đại biểu toàn quốc Hội Sinh viên VN lần thứ 9.

Nhân dịp khánh thành cột cờ, Trung ương Hội Sinh viên VN trao tặng 500 triệu đồng cho Tỉnh đoàn Quảng Ngãi để xây dựng công trình thanh niên Trường mẫu giáo xã Nghĩa An (huyện Tư Nghĩa). Quỹ hỗ trợ và phát triển sinh viên VN tặng 1 máy tính cho Huyện đoàn Lý Sơn và 10 suất học bổng (1 triệu đồng/suất) cho học sinh có hoàn cảnh khó khăn ở Lý Sơn. Thành đoàn Hà Nội tặng công trình điện năng lượng mặt trời thắp sáng khu vực cột cờ, có trị giá 200 triệu đồng.
 
Cùng đó, Trung ương Hội Sinh viên Việt Nam kêu gọi các cơ sở đóng góp cờ để duy trì cờ treo lâu dài. Đến nay, sinh viên cả nước đã gửi về 158 lá cờ và vẫn đang tiếp tục ủng hộ. Lá cờ và cột cờ do Huyện đoàn Lý Sơn nhận và quản lý.

Cột cờ Tổ quốc đứng hiên ngang và sững sững trên đỉnh Thới Lới ở đảo Lý Sơn không chỉ có ý nghĩa nhân văn mà là một“cột mốc sống” khẳng định chủ quyền lãnh thổ của dân tộc. Công trình cũng là hiện thân của sự chung sức, đồng lòng, sẵn sàng bảo vệ lãnh thổ đất nước của thế hệ trẻ toàn quốc.